LAMMPS是一款經典的分子動力學套件，專門針對能夠在平行系統上順暢地執行而量身設計。CUDA版本的LAMMPS是透過將力計算(force calculations)移轉到繪圖處理器上來進行加速。

下載與安裝

• GPU LAMMPS

  • • GPU LAMMPS碼可支援MPI，並可發展為一個大型的GPU叢集。

測試數據

您可以從以下測試結果看出，利用繪圖處理器執行LAMMPS將呈現出顯著的效能提升。利用兩顆Tesla繪圖處理器執行 GPU-LAMMPS的效能表現甚至比用24個CPU來執行程式的結果還要優異。

技術文章與簡報

• • 2009年超級電腦大會(SC09): 駕馭GPU的優異速度，為LAMMPS粒子模擬工作進行加速 - 桑迪亞國家實驗室(Sandia National Laboratory)Paul Crozier

• 利用GPU為分子動力學應用程式進行加速

• 利用GPU為量子化學應用程式進行加速

論壇

• GPUcomputing.net上以GPU為基礎的分子模擬社群

GPU 解決方案

使用者可在搭載繪圖處理器的桌上型個人超級電腦或資料中心中，進行Tesla Bio Workbench應用程式配置。 這些建構於革命性大量平行CUDA架構上的解決方案是針對加速運算科學的研究結果而量身設計而成。

建議硬體配置