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NVIDIA® Tesla™ GPU處理器正讓生物物理學家和計算化學家達成前所未有的改革創新。採用Tesla GPU,將您的PC升級為個人超級電腦,運算效能提升至機架伺服器等級!為數眾多的軟體──如AMBER、NAMD、GROMACS、LAMMPS、TeraChem…等,透過Tesla GPU加速皆可達到10倍以上的傲人效能!
若您正在使用AMBER、NAMD或GROMACS,我們提供您限期免費使用Tesla個人超級電腦進行您的分子模擬演算,無其他使用限制與附帶條件。
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Tesla系列的優點並與Geforce系列比較
Tesla Bio Workbench Applications
台灣地區的Bio workbench的翻譯網頁
AMBER軟體中的Generalized Born與 PMEMD 模擬功能是利用CUDA技術的繪圖處理器進行加速而完成的。透過搭配以CUDA架構所建構的Tesla GPU運算解決方案,可提供高達7倍至8倍的效能加速。
GROMACS是一款分子動力學套裝軟體,專為如蛋白質、油脂和核酸等擁有許多複雜的鍵結相互作用之生化分子的模擬而設計。
HOOMD-blue是一款為了完整利用NVIDIA繪圖處理器中革命性CUDA架構的強大威力,而從無到有寫成的通用型粒子動力學軟體套件。這款軟體套件包含了一些不同的力場(force field)與整合物件,而其物件導向設計更使得這套軟體在添加額外物件上變得更加容易。
LAMMPS是一款經典的分子動力學套件,專門針對能夠在平行系統上順暢地執行而量身設計。CUDA版本的LAMMPS是透過將力計算(force calculations)移轉到繪圖處理器上來進行加速。
從2007年開始,伊利諾大學香檳分校(UIUC)的研究團隊便使其 奈米分子動力學 (NAMD)利用CUDA加速將速度提升。
TeraChem是首款專為完整利用NVIDIA繪圖處理器之大量平行CUDA架構的強大威力而重頭設計的通用型量子化學軟體套件。TeraChem目前針對密度泛函理論(density functional theory, DFT)與Hartree-Fock (HF)計算方法提供支援。
VMD是一款利用3D繪圖技術與內建命令稿來顯示、模擬與分析大型生物分子系統的分子視覺化程式。VMD中許多重要的核心與應用目前皆利用NVIDIA繪圖處理器之大量平行CUDA架構的強大威力而完成。利用NVIDIA CUDA繪圖處理器執行這些應用程式的速度將比僅透過一顆CPU來運算要快上20倍到100倍,而我們在以下內文中還會繼續討論。
SuperServer 7046GT-TRFTry a SuperServer Tesla PSC.
我們提供您的系統包含以下規格以及安裝元件:
4 NVIDIA Tesla Fermi C2050 GPUs
Intel Xeon "Westmere" 5600 series CPUs (Intel Xeon Nehalem X5650 2.66GHz 12M 以上 x2)
16GB~192GB DDR3 memory (4G REG ECC DDR3 1333 DIMM x4)
Linux OS with AMBER, NAMD, and GROMACS installed
可申請使用不同OS,Win 64 or other linux